從改教以后到近代，關于基督的教義，有兩種主要的異端︰一為蘇西尼學派，一為基督人性先存說。
蘇西尼（Laelius Socinus，1525一1562）為意大利宗教改革家，出身名門，早歲不甚好學；旋赴瑞士巴賽爾（Basel），研究神學；后又遷波蘭之克拉科（Cracaw）渡其余年，于拉科維亞（Racovia）創辦學院，望重一時；各方信徒，慕名前往、奉為宗師。惟于一六五八年，該派受當局干涉，門徒星散。
此派雖承認聖經的權威，並且反對自然宗教和自然神學，認為超自然的啟示，為人類宗教知識唯一的淵源，基督教乃是獨一的宗教。可惜蘇氏之誤，在以人類理性為衡量聖經真理之尺度，以是對于普世教會之信仰，尤其三位一體論，以及基督贖罪論，均持反對之見。蘇氏認為神體只有一位，主耶穌乃是人，不是神；他和一般世人，僅有如下各種不同之特點︰
1．他的不可思議的懷孕和降生；
2．他完全無罪；
3．他領受一種特殊的聖靈之浸；
4．他在傳道之時，曾被提升天，朝見上帝，得到上帝直接的教訓；
5．他複活升天以后，得到了天上地下所有的權柄，這才使他遠超眾生，成為上帝統治宇宙的代表；
6．他自升入尊榮之境，得到這些權柄，遂被稱為上帝，而受人敬拜；
7．他是人類的救主──不僅是因為他是先知和祭司；而尤因為他是君王。
基上各點，可知蘇西尼本人，雖不認主耶穌為真神，但卻沒有否認他各種超凡的特性。不幸現代英美各國所謂蘇西尼的信徒，竟變本加厲，每況愈下，僅以主耶穌是一個凡人，否認一切超凡的特性。例如，現代的「神體一位論派」（Unitarians），不但反對三位一體論，且尤否認主耶穌基督的神性，實在集蘇西尼派、亞流派、半亞流派，以及人道主義者（Humanitarians）一切異端邪說之大成﹗
這派思想，可以兩人為代表，一為瑞典堡氏（Swedenborg l688－1772）；一為華茲氏（Isaac Watts l694－1748）。茲分陳之︰
瑞氏原為瑞典著名科學家和哲學家，后忽棄其所學，研究宗教，自命曾經過一種非常神秘的方式，受神呼召，得到上帝特別的啟示，得窺上帝聖道的奧秘，認為當時的教會，已經失敗，都不明白聖經的真理。從而本其學說，創立一種所謂「新耶路撒冷教會」（Church of New Jerusalam）。瑞氏學說，非常神秘，甚難索解，茲特就其要旨，析陳如后︰
1．論上帝──瑞氏謂上帝不僅是一種本質（Essence）而複有其形相（Form），這個形相便是人。他稱上帝為「永在的神──人」。瑞氏反對「三位一體」論，以為這乃是上帝三位論（Tritheism）；因為神的本質只有一個，所以神的位格，也只有一個。上帝只有一位，所謂聖父、聖子、聖靈，好比人之有身體與靈魂。從其神性說，是聖父；從其人性說，是聖子；而聖靈只是聖父聖子所發的功能與感力。
2．論世人──人類乃是照上帝形像而造，乃為萬物之靈。人體有兩種，一為物質的，一為屬靈的。人死以后，靈魂便藉著「以太」繼續存在，這便是瑞氏心目中的所謂複活。聖經中關于人類犯罪的記載，瑞氏認為只是對教會背道的一種比論，並非確有其事。他雖承認人性有罪，偏向邪惡，但並未失去其行善的能力。瑞氏認為人類所以需要救贖，乃在使其脫離邪惡，保持行善的能力。人類藉肉體，能與感覺界有交通；同理，人類藉著靈體，也可和靈界往來。瑞氏常常說，他本人曾與上帝，天使和邪靈談話。
3．論基督──瑞氏謂主耶穌基督乃是耶和華，乃是獨一的永生的真神，是宇宙萬物的創造者，和統治者。他乃是在永世裡早已存在的神和人；他的人性在降世以前，已先存在，藉著童貞女感孕，便在肉身顯現，這便是道成肉身。他的肉身曾受苦受死，但和常人不同。所以，他的肉身不是永在墳墓之中，而是漸漸精煉，變成永遠的靈體。
4．論救贖──瑞氏完全反對正統教會救贖的道理。他認為主的救贖工作，不是在十字架上擔當世人的罪，滿足上帝公義的要求，稱義的條件，乃在罪人之悔改。易言之，得救須靠自己，須內心公義，才能進到上帝及眾天使面前。
華氏是英國著名的贊美詩歌作者，以其敬虔稱，為「非國教派」（Non-Comformis）的牧師，篤信三位一體，在其全集中，亦有關于「三一論」的著作。惜其「基督論」攙雜了亞流派之成分。華氏關于主耶穌基督位格的學說，可以其在一七四六年所著「神人基督之榮耀」三篇論文為代表。
1. 基督論上篇──大旨謂在道成肉身前向亞伯拉罕等顯現的神的使者，就是基督。舊約經文中所指稱的「耶和華」、「上帝」和「主」，也是基督，一切屬神的特性和特權，都歸給他。從其人性而論，乃是一切受造物之首先的，至大的，至聖的，和最有智慧的。
2．基督論中篇──此篇乃從基督尊榮之境，論基督的人性和權能。華氏謂基督雖降世為人，但因其人性和神性相聯，所以只要他想行神跡，便立刻能行。因此他可用上帝的命令，統治世界。
3．基督論下篇──此篇旨在証明；耶穌人性之先存，華氏用許多經文，証明他自己的理論，認為主耶穌在沒有降世之前，即已有其依存的受造的特性。例如，他是神的使者，它是上帝的形像；既為「使者」和「形像」，他必已為受造之物。又如聖經說，他是「人子」，是「獨生子」；這又証明他的依存性，他是「由來物」。
4．此說之謬妄
a. 誤解「道成肉身」的真諦──經雲︰「太初有道，道與上帝同在，道就是上帝。」（約一1）「道」既是「上帝」，則太初先存的，與上帝同在的，乃是「道」，並不是「神一人」，「道成肉身」，乃是「上帝在肉身顯現」（提前三16），取得人的真實的身體，和理性的靈魂；並不是先存的「神一人」，（A God-man）取得物質的身體。
b．武斷曲解聖經的原義──解經之道，最忌先抱成見，斷章取義，任意武斷。此派之誤，乃在專門援用一些足以適用在基督神人二性任何一性的經文，從而牽強附會，証明其所謂「人性先存」的謬論。
c. 不明基督虛己的真理──此派以為主耶穌基督的人性的靈乃是首先的，最高超的，冠乎一切受造的諸靈甚至加百列天使之上。使人對他可望而不可即。這種學說，顯然違反聖經的真理，而且勢必使其不能體恤人類的軟弱。聖經教訓我們，他雖是真正的神，卻又是真正的人，不以自己與上帝同等為強奪的，反倒虛己，取了奴仆的形像，照樣取了血肉之體，稱我們為弟兄，不以為恥；他除了沒有犯罪以外，也幾事受過試探，故能體恤我們的軟弱。他不是高高在上，凜不可犯，乃是可以憑我們的信心和愛他的心，和他相親；可以坦然無懼的到他的施恩寶座之前，得憐恤，蒙恩惠。